RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 AGPSO00116 658 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MAP9Q49MG5 647 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MLKLQ8NB16 471 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 PALLDQ8WX93 1383 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP25P42331 645 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 CNPY4Q8N129 248 aa24.09■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 POTEDQ86YR6 584 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 FAM212AQ96EL1 285 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 DACH1Q9UI36 760 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 PRC1O43663 620 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 NLRP6P59044 892 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 COPRSQ9NQ92 184 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 SAMM50Q9Y512 469 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MAST3O60307 1309 aa24.08■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MORC3Q14149 939 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 FBXL16Q8N461 479 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ALG1Q9BT22 464 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MYBL2P10244 700 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ERVK-24P63145 666 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GRIN2DO15399 1336 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PTPRUQ92729 1446 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.07■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SHTN1A0MZ66 631 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ENC1O14682 589 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GYPCP04921 128 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 KRT40Q6A162 431 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MMS19Q96T76 1030 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SLIT1O75093 1534 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MYO1FO00160 1098 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PBX1P40424 430 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 NBPF3Q9H094 633 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.06■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GNGT1P63211 74 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PPFIA1Q13136 1202 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 STX17P56962 302 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GRIN1Q05586 938 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.05■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 PLCD1P51178 756 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GBP6Q6ZN66 633 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CNGA4Q8IV77 575 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 M0R2C6 588 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SRGAP2O75044 1071 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 MCM3P25205 808 aa24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CABS1Q96KC9 395 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 ANTXR2P58335 489 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.03■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GCKRQ14397 625 aa24.02■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 H0YHG0 523 aa24.02■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 RXRAP19793 462 aa24.02■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 TDO2P48775 406 aa24.02■■□□□ 1.44
ODC1-201ENST00000234111 GPTP24298 496 aa24.01■■□□□ 1.43
ODC1-201ENST00000234111 CDC25AP30304 524 aa24.01■■□□□ 1.43
ODC1-201ENST00000234111 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms