RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZR54 194 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087X002 238 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 PANO1I0J062 215 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 RTL8CO15255 209 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GU69 56 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 Q5W150 140 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 Q96NJ1 140 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 CDK2AP2O75956 126 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 ACYP2P14621 99 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf177Q52M58 125 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GVX0 72 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 LY6G6CO95867 125 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 CRIPTQ9P021 101 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH2Q9P225 4427 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 UQCR11O14957 56 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-211ENST00000618610 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 APLNQ9ULZ1 77 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF861PO60384 105 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK1P00995 79 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 SPRR1BP22528 89 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 PKHD1P08F94 4074 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 LCE2CQ5TA81 110 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 DMAC1Q96GE9 116 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 LCE2BO14633 110 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 ROMO1P60602 79 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2-30P06310 120 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 FAT1Q14517 4588 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 NUPR2A6NF83 97 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-2P60368 255 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WTM6 91 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 P0C880 135 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-211ENST00000618610 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 A8MUU9 505 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV7-43P04211 117 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N1X5 172 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 MYCBP2O75592 4640 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 H0YAA0 97 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00483Q53H64 154 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZSA8 131 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-1P60331 282 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRT-211ENST00000618610 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFAF8A1L188 74 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GU33 70 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 RYR3Q15413 4870 aa4.54□□□□□ -1.68
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