RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614484.4

SRRT-215, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-215ENST00000614484 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.47□□□□□ -1.21
SRRT-215ENST00000614484 K7EQZ3 153 aa7.47□□□□□ -1.21
SRRT-215ENST00000614484 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.47□□□□□ -1.21
SRRT-215ENST00000614484 A0A096LNI7 61 aa7.47□□□□□ -1.21
SRRT-215ENST00000614484 DSCR10P59022 87 aa7.46□□□□□ -1.21
SRRT-215ENST00000614484 C1orf137Q5JT78 98 aa7.46□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.46□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP10-1P60331 282 aa7.44□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 Q8NBF4 154 aa7.44□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 H0Y9P7 68 aa7.43□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 C14orf177Q52M58 125 aa7.43□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 REG3GQ6UW15 175 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 A0A1W2PNN7 141 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 H3BPC8 53 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-215ENST00000614484 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.4□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 P0C880 135 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 CDK2AP2O75956 126 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 SPRR4Q96PI1 79 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 FAT1Q14517 4588 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 A0A1B0GVY2 172 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 C7orf33Q8WU49 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 Q6ZRX8 168 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.34□□□□□ -1.23
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.33□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 A0A0G2JQZ4 141 aa7.31□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.31□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.3□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.29□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.28□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.28□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 J3QL48 77 aa7.28□□□□□ -1.24
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.27□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 A0A087WSZ3 146 aa7.26□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.26□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.25□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 IGFL1Q6UW32 110 aa7.25□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 LINC00483Q53H64 154 aa7.24□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 HSPG2P98160 4391 aa7.24□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 SPRR1AP35321 89 aa7.23□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 PRLHP81277 87 aa7.23□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.22□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 ZNF861PO60384 105 aa7.21□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 RYR1P21817 5038 aa7.21□□□□□ -1.25
SRRT-215ENST00000614484 Q6ZSA8 131 aa7.21□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.2□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 A8MWP4 228 aa7.2□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 PCOTHQ58A44 107 aa7.2□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.2□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 LUZP6Q538Z0 58 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 NDUFAF8A1L188 74 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 HRES1P13985 223 aa7.17□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 MYCBP2O75592 4640 aa7.16□□□□□ -1.26
SRRT-215ENST00000614484 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 UQCR11O14957 56 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 A8MUU9 505 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 Q5VSD8 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 K7ERS5 55 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-215ENST00000614484 A0A1B0GU69 56 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 FAM229AH3BQW9 127 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 IGLV7-43P04211 117 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.05□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.05□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 DMAC1Q96GE9 116 aa7.02□□□□□ -1.28
SRRT-215ENST00000614484 HERC2O95714 4834 aa7.01□□□□□ -1.29
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SRRT-215ENST00000614484 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.98□□□□□ -1.29
SRRT-215ENST00000614484 Q8N1X5 172 aa6.98□□□□□ -1.29
SRRT-215ENST00000614484 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.97□□□□□ -1.29
SRRT-215ENST00000614484 SPRR1BP22528 89 aa6.95□□□□□ -1.3
SRRT-215ENST00000614484 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SRRT-215ENST00000614484 Q5W150 140 aa6.94□□□□□ -1.3
SRRT-215ENST00000614484 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.93□□□□□ -1.3
SRRT-215ENST00000614484 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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