RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIF1AQ12756 1690 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMA1P25391 3075 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 CEP290O15078 2479 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 S4R3F8 94 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 RYR1P21817 5038 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRIP1P50238 77 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 KALRNO60229 2985 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 MTORP42345 2549 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIOO75962 3097 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 RELNP78509 3460 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BVH4 76 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 WT1-ASQ06250 92 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 MADDQ8WXG6 1647 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCC6O95255 1503 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACACBO00763 2458 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 LY75O60449 1722 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITPR3Q14573 2671 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 RYR3Q15413 4870 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATXN8Q156A1 80 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACACAQ13085 2346 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMA3Q16787 3333 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 TIAM1Q13009 1591 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCA6Q8N139 1617 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 MT1HP80294 61 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDCD5O14737 125 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 FCER1GP30273 86 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 EFCAB5A4FU69 1503 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BUA1 57 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 GLI2P10070 1586 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 TNP1P09430 55 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 RYR2Q92736 4967 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB1P60022 68 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms