RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 Q8N1X5 172 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00167Q96N53 147 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1B0GVY2 172 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 FAM168BA1KXE4 195 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 COA5Q86WW8 74 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 A6NN06 94 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1W2PNN7 141 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 PRLHP81277 87 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 PCOTHQ58A44 107 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.46□□□□□ -1.85
PTPRB-206ENST00000548122 MOBPQ13875 183 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 ROMO1P60602 79 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 PANO1I0J062 215 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF861PO60384 105 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZRX8 168 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 LYSTQ99698 3801 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 A0A087WSZ3 146 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1B0GVX0 72 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZSA8 131 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 SPINK7P58062 85 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 Q5VV11 94 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 K7EQZ3 153 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 SPINK1P00995 79 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 Q8N377 158 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0G2JQZ4 141 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-206ENST00000548122 Q8NDZ9 215 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1W2PNM2 257 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 SPRR4Q96PI1 79 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 A8MUU9 505 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 DSCR10P59022 87 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 SPRR1AP35321 89 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRB-206ENST00000548122 IGFL1Q6UW32 110 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 R4GN34 69 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 RYR2Q92736 4967 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 A0A087X002 238 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 SPRR1BP22528 89 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 PP632Q6XCG6 107 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 C9orf92A6NGG3 77 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 HRES1P13985 223 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-206ENST00000548122 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 RYR3Q15413 4870 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KMT2AQ03164 3969 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP10-8P60410 259 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 Q96NJ1 140 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms