RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 CCL18P55774 89 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 PRCDQ00LT1 54 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C7orf33Q8WU49 177 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00167Q96N53 147 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 H3BPC8 53 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 NCR3O14931 201 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1-17P01599 117 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB1P60022 68 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SPINK9Q5DT21 86 aa4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 H0Y9P7 68 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP10-1P60331 282 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 NDUFA1O15239 70 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB130BP0DP73 79 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB130AP0DP74 79 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00315P59091 139 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C1orf137Q5JT78 98 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 Q8TAT8 98 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A8MTW9 85 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 CRIP1P50238 77 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 LINC00483Q53H64 154 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DMAC1Q96GE9 116 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGHV3-53P01767 116 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A0A087WTM6 91 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 INSP01308 110 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 MGPP08493 103 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 H3BNG1 76 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 P0C880 135 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 C16orf74Q96GX8 76 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GVX0 72 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 SPINK7P58062 85 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 UQCR11O14957 56 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGKV4-1P06312 121 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 PRR34Q9NV39 138 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 A0A096LPF7 62 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 HTN1P15515 57 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 LYZP61626 148 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 COA5Q86WW8 74 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZTI0 123 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 RNF213Q63HN8 5207 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 DSCR10P59022 87 aa4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SPRR4Q96PI1 79 aa4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 LRP2P98164 4655 aa4.71□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 A8MUU9 505 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZSA8 131 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 C15orf56Q8N910 161 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 NDUFAF8A1L188 74 aa4.7□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 H3BRN7 92 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TNXBP22105 4242 aa4.67□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 PRO0255Q9UI72 69 aa4.67□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 COX7BP24311 80 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.65□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 PANO1I0J062 215 aa4.65□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 Q8NBF4 154 aa4.65□□□□□ -1.66
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