RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CATR1Q13166 79 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-212ENST00000491302 M0R135 149 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 IFNGP01579 166 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG11BQ08648 103 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG11AQ6PDA7 123 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 PP6455Q8WZ26 134 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 V9GYH0 126 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 H0YAA0 97 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 Q0VG73 95 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GWA3 101 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 CNFNQ9BYD5 112 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SCN3BQ9NY72 215 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SSSCA1O60232 199 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 PRCDQ00LT1 54 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-212ENST00000491302 SFTA3P0C7M3 94 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MT1GP13640 62 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MT1XP80297 61 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 ENHOQ6UWT2 76 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf38Q86SI9 138 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MT1MQ8N339 61 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 DLEU1O43261 78 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2D2P62837 147 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 RPL39P5Q59GN2 51 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM203Q969S6 136 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MGST2Q99735 147 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MT1EP04732 61 aa0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 SPINK4O60575 86 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 COX17Q14061 63 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM262E9PQX1 116 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 I3L2K1 104 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 HMGN4O00479 90 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5AP00167 134 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 AMELXQ99217 191 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GV90 55 aa0.47□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.47□□□□□ -2.33
PTPRC-212ENST00000491302 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 A8MTW9 85 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 KLK9Q2XQG4 91 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 S100A3P33764 101 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WWC5 75 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 K7EIM0 57 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 SNAPC5O75971 98 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 FAM24AA6NFZ4 105 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 RPL38P63173 70 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 BAGE2Q86Y30 109 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 F8VRH5 84 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 UQCR11O14957 56 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 BCE1O60756 84 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 APOC3P02656 99 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 IGLC7A0M8Q6 106 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 RBP2P50120 134 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 PIGYQ3MUY2 71 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 WT1-ASQ06250 92 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 CGREF1Q99674 301 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 V9GYS6 101 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 GNG4P50150 75 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00032P0C843 101 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 IFITM1P13164 125 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRLHP81277 87 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 MT1LQ93083 61 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 PKIAP61925 76 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 CORTO00230 105 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 HMGN3Q15651 99 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR4Q96PI1 79 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-212ENST00000491302 F6UZH7 168 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 M0R3E3 92 aa0.33□□□□□ -2.36
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