RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZRX8 168 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 NUPR2A6NF83 97 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 LUZP6Q538Z0 58 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 CASC10Q5T4H9 136 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 HERC2O95714 4834 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 TENM2Q9NT68 2774 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFAF8A1L188 74 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV7-43P04211 117 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-11P60412 298 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 LY6EQ16553 131 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 IGFL1Q6UW32 110 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BUX3 64 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 TLX1NBP0CAT3 122 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 PRO0255Q9UI72 69 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM168BA1KXE4 195 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 Q5W150 140 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 SPRR1AP35321 89 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB136Q30KP8 78 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.96□□□□□ -1.77
RABGGTB-208ENST00000471759 LYSTQ99698 3801 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB130BP0DP73 79 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB130AP0DP74 79 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 RYR1P21817 5038 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087WTM6 91 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 LELP1Q5T871 98 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A096LPF7 62 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 LY6G6CO95867 125 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GVX0 72 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf56Q8N910 161 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0G2JQZ4 141 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PNN7 141 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 PANO1I0J062 215 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 Q96NJ1 140 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 SPRR1BP22528 89 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-208ENST00000471759 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 H0YAA0 97 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 CRIPTQ9P021 101 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GU33 70 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZSA8 131 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV2-30P06310 120 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-208ENST00000471759 PRLHP81277 87 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GVY2 172 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A096LNI7 61 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 TPRXLQ17RH7 258 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BNG1 76 aa3.71□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 HTN3P15516 51 aa3.71□□□□□ -1.81
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 KMT2AQ03164 3969 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 SPINK1P00995 79 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 HERC1Q15751 4861 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.5 ms