RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 LTN1O94822 1766 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A087WXM4 84 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 V9GYS6 101 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1LQ93083 61 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 H3BUA1 57 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 TDRG1Q3Y452 100 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADIRFQ15847 76 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ST20Q9HBF5 79 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCC3O15438 1527 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 FCER1GP30273 86 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 H3BUT2 72 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 M0QZ58 72 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1MQ8N339 61 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 S100A13Q99584 98 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITSN1Q15811 1721 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIF14Q15058 1648 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITPR2Q14571 2701 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT2AP02795 61 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1GP13640 62 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 AKAP12Q02952 1782 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 M0QY20 66 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIF1AQ12756 1690 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 A8MTW9 85 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 TJP1Q07157 1748 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 RICTORQ6R327 1708 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 LY75O60449 1722 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 H3BVH4 76 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCC1P33527 1531 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPLO60437 1756 aa-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms