RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACYP2P14621 99 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR1AP35321 89 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MUU9 505 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EIL1 84 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRIPTQ9P021 101 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00483Q53H64 154 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFAF8A1L188 74 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMAC1Q96GE9 116 aa6.43□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.42□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.42□□□□□ -1.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 PANO1I0J062 215 aa6.4□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q5W150 140 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV7-43P04211 117 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q96NJ1 140 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GVX0 72 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3C-201ENST00000361441 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3C-201ENST00000361441 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3C-201ENST00000361441 LUZP6Q538Z0 58 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 H0YAA0 97 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 APLNQ9ULZ1 77 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WTM6 91 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPINK1P00995 79 aa6.23□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 TGP01266 2768 aa6.23□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.22□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.22□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUPR2A6NF83 97 aa6.21□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR1BP22528 89 aa6.21□□□□□ -1.41
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZSA8 131 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7ERS5 55 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 C14orf177Q52M58 125 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.18□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 KMT2AQ03164 3969 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6G6CO95867 125 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH2Q9P225 4427 aa6.15□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.15□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBN3Q75N90 2809 aa6.15□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.15□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.13□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.13□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNHD1Q96M86 4753 aa6.12□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2-30P06310 120 aa6.09□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.09□□□□□ -1.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPRXLQ17RH7 258 aa6.08□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.08□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.08□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GU33 70 aa6.07□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.06□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.06□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM229AH3BQW9 127 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N1X5 172 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC3C-201ENST00000361441 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-2P60368 255 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.91□□□□□ -1.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.89□□□□□ -1.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.86□□□□□ -1.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.85□□□□□ -1.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.85□□□□□ -1.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-1P60331 282 aa5.84□□□□□ -1.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0D9SG42 100 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKD1P98161 4303 aa5.79□□□□□ -1.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.76□□□□□ -1.49
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKHD1P08F94 4074 aa5.75□□□□□ -1.49
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