RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 COX7BP24311 80 aa3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 LINC00575Q6W349 94 aa3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZQT0 140 aa3.78□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.77□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GW54 56 aa3.77□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 SPRR1AP35321 89 aa3.77□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-1P60331 282 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GVY2 172 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 A8MWP4 228 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 SPINK7P58062 85 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.76□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 FAT1Q14517 4588 aa3.75□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZRX8 168 aa3.75□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZSA8 131 aa3.75□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 NDUFAF8A1L188 74 aa3.74□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.74□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 Q9BRP9 147 aa3.74□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 RYR3Q15413 4870 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 OCR1Q9BZK8 76 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZQY7 126 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 SMIM29Q86T20 159 aa3.73□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 PRLHP81277 87 aa3.72□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.72□□□□□ -1.81
CCR6-201ENST00000341935 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PNM2 257 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 C1orf137Q5JT78 98 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 COA5Q86WW8 74 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 H0Y9P7 68 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.7□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.69□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.69□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.68□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 Q8N377 158 aa3.68□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 IGLV7-43P04211 117 aa3.67□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 ZNF861PO60384 105 aa3.67□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.66□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.66□□□□□ -1.82
CCR6-201ENST00000341935 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.65□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 IGKV4-1P06312 121 aa3.65□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 SPRR1BP22528 89 aa3.65□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.64□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 SPRR4Q96PI1 79 aa3.64□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 MUC17Q685J3 4493 aa3.64□□□□□ -1.83
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CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GU69 56 aa3.61□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.61□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 PCOTHQ58A44 107 aa3.61□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.6□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.6□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 IGFL1Q6UW32 110 aa3.6□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.59□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.59□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.59□□□□□ -1.83
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JQZ4 141 aa3.59□□□□□ -1.84
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CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 Q8NBF4 154 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCR6-201ENST00000341935 CRIPTQ9P021 101 aa3.58□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.57□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 RYR1P21817 5038 aa3.57□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 UQCR11O14957 56 aa3.57□□□□□ -1.84
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CCR6-201ENST00000341935 Q5VSD8 79 aa3.56□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.55□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 A8MUU9 505 aa3.54□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 DMAC1Q96GE9 116 aa3.54□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.54□□□□□ -1.84
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WSZ3 146 aa3.53□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 Q8N1X5 172 aa3.52□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.52□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 K7EQZ3 153 aa3.51□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.51□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.49□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.48□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 Q96NJ1 140 aa3.48□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.48□□□□□ -1.85
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