RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q8N9L7	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	LCE6A	A0A183	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	NREP	Q16612	68 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1W2PNM2	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRLH	P81277	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	BPY2	O14599	106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	BCE1	O60756	84 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q8NBF4	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	RYR3	Q15413	4870 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	PANO1	I0J062	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	RYR2	Q92736	4967 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A0U1RQV1	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GW54	56 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		F8WEM9	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901		H7BZZ5	65 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBE2A	P49459	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DSCR10	P59022	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZR54	194 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901		K7EQZ3	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A087WSZ3	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901		H0Y9J4	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A087WTM6	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	RTL8C	O15255	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPRR1B	P22528	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	CD164	Q04900	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	NDUFC1	O43677	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	PKD1	P98161	4303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901		A8MWP4	228 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GVY2	172 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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