RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 APLNQ9ULZ1 77 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 LCE6AA0A183 80 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 PSCAO43653 123 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 C5orf47Q569G3 176 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 PANO1I0J062 215 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.27□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WSZ3 146 aa8.27□□□□□ -1.08
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.27□□□□□ -1.08
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C9orf170-201ENST00000623052 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 HCG22E2RYF7 251 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 SPRR1BP22528 89 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2AP49459 152 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 H0Y9J4 135 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 KMT2AQ03164 3969 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH2Q9P225 4427 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 C14orf177Q52M58 125 aa8.21□□□□□ -1.09
C9orf170-201ENST00000623052 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 B9D2Q9BPU9 175 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 MDFIQ99750 246 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.17□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 FBN3Q75N90 2809 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf170-201ENST00000623052 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 PRR15Q8IV56 129 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 hDV103S1A0JD37 113 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 A8MWP4 228 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 Q96NJ1 140 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 NUPR2A6NF83 97 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 CASC2Q6XLA1 102 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf170-201ENST00000623052 PRR4Q16378 134 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.08□□□□□ -1.12
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C9orf170-201ENST00000623052 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WTM6 91 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00483Q53H64 154 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00208Q96KT6 92 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 H0Y9P7 68 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 MOBPQ13875 183 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 MP68P56378 58 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf170-201ENST00000623052 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 RTL8CO15255 209 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 PRO0628Q9UI54 55 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 DNHD1Q96M86 4753 aa8□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZR54 194 aa8□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB1O75438 58 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 Q1T7F1 81 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 H3BPC8 53 aa7.96□□□□□ -1.13
C9orf170-201ENST00000623052 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 BRK1Q8WUW1 75 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 TGP01266 2768 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087X002 238 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF861PO60384 105 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GVX0 72 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf170-201ENST00000623052 PKD1P98161 4303 aa7.9□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 PSPHP1O15172 72 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 CD164Q04900 197 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.88□□□□□ -1.15
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