RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.04□□□□□ -0.96
UBE2C-208ENST00000617055 A8MUU9 505 aa9.03□□□□□ -0.96
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UBE2C-208ENST00000617055 NDUFA5Q16718 116 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 LST1O00453 97 aa9□□□□□ -0.97
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UBE2C-208ENST00000617055 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.98□□□□□ -0.97
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UBE2C-208ENST00000617055 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.97□□□□□ -0.97
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UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZQY7 126 aa8.94□□□□□ -0.98
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UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.91□□□□□ -0.98
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UBE2C-208ENST00000617055 HRES1P13985 223 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 DSCR10P59022 87 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 H3BUT2 72 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PET117Q6UWS5 81 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NEBP20929 6669 aa8.86□□□□□ -0.99
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UBE2C-208ENST00000617055 SCGB1D1O95968 90 aa8.82□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.82□□□□□ -1
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UBE2C-208ENST00000617055 TEN1Q86WV5 123 aa8.77□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 A0A087WSZ3 146 aa8.76□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 C3orf79P0CE67 100 aa8.75□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00313P59037 77 aa8.75□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 MTURNQ8N3F0 131 aa8.74□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SIGMAR1Q99720 223 aa8.74□□□□□ -1.01
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UBE2C-208ENST00000617055 KRTDAPP60985 99 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 A8MWP4 228 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BKO60814 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BJP06899 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BOP23527 126 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BDP58876 126 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBE2C-208ENST00000617055 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBE2C-208ENST00000617055 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 ATOH7Q8N100 152 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 C12orf57Q99622 126 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 IGKV4-1P06312 121 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.62□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 H3BMG7 143 aa8.59□□□□□ -1.03
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UBE2C-208ENST00000617055 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.56□□□□□ -1.04
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UBE2C-208ENST00000617055 SPINK7P58062 85 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.54□□□□□ -1.04
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UBE2C-208ENST00000617055 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 FABP2P12104 132 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 H0YGX0 51 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 GHRHP01286 108 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 C8orf87E5RJ46 101 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H4GQ99525 98 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 RAB37Q96AX2 223 aa8.44□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GVX0 72 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A6NN06 94 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GV72 72 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GX51 115 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 TRACP01848 142 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 CCKP06307 115 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 MDN1Q9NU22 5596 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 KMT2DO14686 5537 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 A0A0B4J2C4 111 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP5-9P26371 169 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.31□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.28□□□□□ -1.08
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