RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.04□□□□□ -0.96
UBE2C-208ENST00000617055 A8MUU9 505 aa9.03□□□□□ -0.96
UBE2C-208ENST00000617055 TRGC2P03986 189 aa9.03□□□□□ -0.96
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFA5Q16718 116 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 LST1O00453 97 aa9□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 COPS9Q8WXC6 57 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2C-208ENST00000617055 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 IFITM1P13164 125 aa8.94□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.94□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZQY7 126 aa8.94□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.93□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00575Q6W349 94 aa8.92□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 VAMP3Q15836 100 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 LINC01545Q5VT33 79 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2C-208ENST00000617055 hADV29S1A0JD25 119 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZVH6 145 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 HRES1P13985 223 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 DSCR10P59022 87 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 H3BUT2 72 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PET117Q6UWS5 81 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NEBP20929 6669 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.83□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 SCGB1D1O95968 90 aa8.82□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.82□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.8□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.79□□□□□ -1
UBE2C-208ENST00000617055 TEN1Q86WV5 123 aa8.77□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 A0A087WSZ3 146 aa8.76□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 C3orf79P0CE67 100 aa8.75□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00313P59037 77 aa8.75□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 MTURNQ8N3F0 131 aa8.74□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SIGMAR1Q99720 223 aa8.74□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 COLCA2A8K830 154 aa8.73□□□□□ -1.01
UBE2C-208ENST00000617055 KRTDAPP60985 99 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 A8MWP4 228 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BKO60814 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BJP06899 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BOP23527 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BBP33778 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BDP58876 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BCP62807 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 ATOH7Q8N100 152 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 C12orf57Q99622 126 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2C-208ENST00000617055 IGKV4-1P06312 121 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.62□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 H3BMG7 143 aa8.59□□□□□ -1.03
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1W2PNM2 257 aa8.58□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 SNCGO76070 127 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 SPINK7P58062 85 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2C-208ENST00000617055 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 FABP2P12104 132 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 H0YGX0 51 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 GHRHP01286 108 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2C-208ENST00000617055 C8orf87E5RJ46 101 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H4GQ99525 98 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 RAB37Q96AX2 223 aa8.44□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GVX0 72 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A6NN06 94 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GV72 72 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GX51 115 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 TRACP01848 142 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 CCKP06307 115 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 MDN1Q9NU22 5596 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 KMT2DO14686 5537 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
UBE2C-208ENST00000617055 A0A0B4J2C4 111 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP5-9P26371 169 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.31□□□□□ -1.08
UBE2C-208ENST00000617055 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms