RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.71□□□□□ -0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNP2Q05952 138 aa13.71□□□□□ -0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C14orf177Q52M58 125 aa13.71□□□□□ -0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUPR2A6NF83 97 aa13.69□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIGD2AQ9BW72 106 aa13.69□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa13.69□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MPLKIPQ8TAP9 179 aa13.68□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.68□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0G2JQZ4 141 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM29Q86T20 159 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BRK1Q8WUW1 75 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STARD9Q9P2P6 4700 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q8NBF4 154 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.62□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PANO1I0J062 215 aa13.61□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.61□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR4Q96PI1 79 aa13.56□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGFL1Q6UW32 110 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2AP49459 152 aa13.52□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa13.52□□□□□ -0.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1B0GW54 56 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNHD1Q96M86 4753 aa13.51□□□□□ -0.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB116Q30KQ4 102 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE6AA0A183 80 aa13.46□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A087WTM6 91 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 hDV103S1A0JD37 113 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DSCR10P59022 87 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A087WSZ3 146 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H0Y9J4 135 aa13.43□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7EQZ3 153 aa13.42□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.42□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.41□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf195Q5TG92 126 aa13.41□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KMT2AQ03164 3969 aa13.41□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf64Q8NEQ6 169 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH2Q9P225 4427 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTL8CO15255 209 aa13.37□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR1BP22528 89 aa13.36□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa13.35□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR4Q16378 134 aa13.34□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6ZR54 194 aa13.34□□□□□ -0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HCG22E2RYF7 251 aa13.31□□□□□ -0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q1T7F1 81 aa13.31□□□□□ -0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.3□□□□□ -0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa13.27□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LY6G6CO95867 125 aa13.27□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSPHP1O15172 72 aa13.26□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 V9GYY9 64 aa13.25□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.25□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.25□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.25□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.25□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TGP01266 2768 aa13.24□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WFDC13Q8IUB5 93 aa13.24□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa13.24□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV22A0A0B4J277 110 aa13.22□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR15Q8IV56 129 aa13.22□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBN3Q75N90 2809 aa13.22□□□□□ -0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.2□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.2□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.19□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.18□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.17□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFB1O75438 58 aa13.16□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MP68P56378 58 aa13.15□□□□□ -0.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00208Q96KT6 92 aa13.14□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MUN3 132 aa13.12□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00483Q53H64 154 aa13.12□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF861PO60384 105 aa13.11□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MWP4 228 aa13.1□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MOBPQ13875 183 aa13.1□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEC61GP60059 68 aa13.1□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.08□□□□□ -0.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASC2Q6XLA1 102 aa13.07□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP10-2P60368 255 aa13.06□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H0Y9P7 68 aa13.05□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13.05□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PMAIP1Q13794 54 aa13.05□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MU10 97 aa13.02□□□□□ -0.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q96NJ1 140 aa13.02□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q5VV11 94 aa13.01□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV7-43P04211 117 aa13□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH5Q8TE73 4624 aa13□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.99□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa12.98□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.98□□□□□ -0.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 232.9 ms