RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV6-57P01721 117 aa4.79□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV7-43P04211 117 aa4.79□□□□□ -1.64
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ZNF548-208ENST00000597576 TEN1Q86WV5 123 aa4.79□□□□□ -1.64
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ZNF548-208ENST00000597576 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.57□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 Q6JHZ5 121 aa4.57□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00643Q86TS7 51 aa4.57□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.57□□□□□ -1.68
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ZNF548-208ENST00000597576 Q8N377 158 aa4.56□□□□□ -1.68
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