RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.3□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.3□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 ERC2-IT1O76042 136 aa10.29□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 RTL8CO15255 209 aa10.28□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 C3orf84H3BNL1 204 aa10.28□□□□□ -0.76
MEIS3-209ENST00000561040 A0A1B0GW54 56 aa10.26□□□□□ -0.77
MEIS3-209ENST00000561040 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.26□□□□□ -0.77
MEIS3-209ENST00000561040 PRLHP81277 87 aa10.24□□□□□ -0.77
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MEIS3-209ENST00000561040 TNP2Q05952 138 aa10.23□□□□□ -0.77
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MEIS3-209ENST00000561040 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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MEIS3-209ENST00000561040 HAMPP81172 84 aa10.22□□□□□ -0.77
MEIS3-209ENST00000561040 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.22□□□□□ -0.77
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MEIS3-209ENST00000561040 SMIM29Q86T20 159 aa10.17□□□□□ -0.78
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MEIS3-209ENST00000561040 Q8NBF4 154 aa10.14□□□□□ -0.79
MEIS3-209ENST00000561040 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
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MEIS3-209ENST00000561040 DNAH2Q9P225 4427 aa10.09□□□□□ -0.79
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MEIS3-209ENST00000561040 KMT2AQ03164 3969 aa10.08□□□□□ -0.8
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
MEIS3-209ENST00000561040 IGFL1Q6UW32 110 aa10.07□□□□□ -0.8
MEIS3-209ENST00000561040 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.06□□□□□ -0.8
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MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP10-2P60368 255 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-209ENST00000561040 C1orf195Q5TG92 126 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-209ENST00000561040 BRK1Q8WUW1 75 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-209ENST00000561040 LINC00483Q53H64 154 aa10.01□□□□□ -0.81
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MEIS3-209ENST00000561040 A0A087WSZ3 146 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-209ENST00000561040 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-209ENST00000561040 LCE6AA0A183 80 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-209ENST00000561040 A0A0G2JQZ4 141 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP10-1P60331 282 aa9.91□□□□□ -0.82
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MEIS3-209ENST00000561040 Q1T7F1 81 aa9.9□□□□□ -0.82
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MEIS3-209ENST00000561040 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.87□□□□□ -0.83
MEIS3-209ENST00000561040 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.87□□□□□ -0.83
MEIS3-209ENST00000561040 hDV103S1A0JD37 113 aa9.87□□□□□ -0.83
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MEIS3-209ENST00000561040 DSCR10P59022 87 aa9.86□□□□□ -0.83
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MEIS3-209ENST00000561040 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.86□□□□□ -0.83
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MEIS3-209ENST00000561040 PKD1P98161 4303 aa9.8□□□□□ -0.84
MEIS3-209ENST00000561040 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
MEIS3-209ENST00000561040 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.79□□□□□ -0.84
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MEIS3-209ENST00000561040 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.77□□□□□ -0.85
MEIS3-209ENST00000561040 A8MWP4 228 aa9.76□□□□□ -0.85
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MEIS3-209ENST00000561040 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.73□□□□□ -0.85
MEIS3-209ENST00000561040 H3BPC8 53 aa9.7□□□□□ -0.86
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MEIS3-209ENST00000561040 Q96NJ1 140 aa9.68□□□□□ -0.86
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