RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617		Q9BRP9	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617		E9PLD3	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	HERV-K104	P63124	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617		J3QQQ9	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	NMU	P48645	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617		Q5XG85	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	GHRH	P01286	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PFN2	P35080	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00158	P58513	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0J9YXY3	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617		B5MCH6	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PRY	O14603	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	TIMM17B	O60830	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0U1RRA0	63 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617		A8MUU9	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	CD164	Q04900	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	LITAF	Q99732	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617		Q96NJ1	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	DLEU1	O43261	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFC2	O95298	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	COX8A	P10176	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	IFITM1	P13164	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	C12orf57	Q99622	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	NCR3	O14931	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	NPC2	P61916	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	DDT	P30046	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZRX8	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ABCD4-222	ENST00000555617	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	SPRR1B	P22528	89 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	TAL2	Q16559	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617		A4D1N5	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PNM2	257 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617		A6NDN8	102 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1X	P80297	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	CEND1	Q8N111	149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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