RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-206ENST00000548122 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRB-206ENST00000548122 Q6JHZ5 121 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-206ENST00000548122 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZQY7 126 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-206ENST00000548122 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.72□□□□□ -1.81
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PTPRB-206ENST00000548122 C22orf24Q9Y442 160 aa3.72□□□□□ -1.81
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PTPRB-206ENST00000548122 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRB-206ENST00000548122 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZQT0 140 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-206ENST00000548122 A8MWP4 228 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRB-206ENST00000548122 BCE1O60756 84 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRB-206ENST00000548122 LCE2CQ5TA81 110 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRB-206ENST00000548122 A8MU10 97 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRB-206ENST00000548122 C15orf56Q8N910 161 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 COL7A1Q02388 2944 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00575Q6W349 94 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 Q1T7F1 81 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-206ENST00000548122 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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