RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 F8WEM9 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF815PA8K554 130 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 TRGC2P03986 189 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 A6NDN8 102 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 LST1O00453 97 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 FAM236CP0DP71 79 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 HRES1P13985 223 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRU-209ENST00000526080 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 IFITM1P13164 125 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01545Q5VT33 79 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00575Q6W349 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZQY7 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 COPS9Q8WXC6 57 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZVH6 145 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRU-209ENST00000526080 hADV29S1A0JD25 119 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 DSCR10P59022 87 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 PET117Q6UWS5 81 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 H3BUT2 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 VAMP3Q15836 100 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRU-209ENST00000526080 COLCA2A8K830 154 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 C3orf79P0CE67 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 TEN1Q86WV5 123 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WSZ3 146 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 MDN1Q9NU22 5596 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00313P59037 77 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 A8MWP4 228 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BKO60814 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BJP06899 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BOP23527 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BBP33778 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BDP58876 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BCP62807 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 SIGMAR1Q99720 223 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 MTURNQ8N3F0 131 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 S100A6P06703 90 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 KRTDAPP60985 99 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 ATOH7Q8N100 152 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRU-209ENST00000526080 KMT2DO14686 5537 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1W2PNM2 257 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV4-1P06312 121 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 C12orf57Q99622 126 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 SPINK7P58062 85 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 H3BMG7 143 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRU-209ENST00000526080 S100A2P29034 98 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-9P26371 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 C8orf87E5RJ46 101 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 RAB37Q96AX2 223 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-209ENST00000526080 H0YGX0 51 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GVX0 72 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 SNCGO76070 127 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 A6NN06 94 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 FABP2P12104 132 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GX51 115 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 GHRHP01286 108 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H4GQ99525 98 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-209ENST00000526080 MT1BP07438 61 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0B4J2C4 111 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 TRACP01848 142 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 CCKP06307 115 aa6.3□□□□□ -1.4
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