RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00575Q6W349 94 aa5.12□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf84H3BNL1 204 aa5.11□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 FAM168BA1KXE4 195 aa5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV6-57P01721 117 aa5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf177Q52M58 125 aa5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf33Q8WU49 177 aa5.1□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 LCE6AA0A183 80 aa5.09□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB1O75438 58 aa5.09□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.09□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 SCXQ7RTU7 201 aa5.09□□□□□ -1.59
TRPS1-208ENST00000519076 LY6G6CO95867 125 aa5.08□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 PRAC1Q96KF2 57 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 CASC2Q6XLA1 102 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 APLNQ9ULZ1 77 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.06□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 CHTF8P0CG12 524 aa5.06□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.06□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 H3BQ85 93 aa5.06□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 TGP01266 2768 aa5.06□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV4-1P06312 121 aa5.05□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 A0A096LNI7 61 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 PRLHP81277 87 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 PRR4Q16378 134 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00208Q96KT6 92 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 Q9BRP9 147 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087X002 238 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 REG3GQ6UW15 175 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.02□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 TLX1NBP0CAT3 122 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRX8 168 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00476Q8WZB0 136 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 Q8N9L7 120 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.99□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PNN7 141 aa4.99□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.98□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM29Q86T20 159 aa4.98□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf137Q5JT78 98 aa4.97□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.97□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 COL7A1Q02388 2944 aa4.97□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.97□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.97□□□□□ -1.61
TRPS1-208ENST00000519076 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.96□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.95□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 Q8N377 158 aa4.95□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WTM6 91 aa4.94□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 RTL8CO15255 209 aa4.94□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 ANK2Q01484 3957 aa4.93□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.93□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JQZ4 141 aa4.93□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.93□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK7P58062 85 aa4.92□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.92□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.92□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.91□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WSZ3 146 aa4.9□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 COA5Q86WW8 74 aa4.9□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.9□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PNM2 257 aa4.89□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.89□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.89□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 H3BPC8 53 aa4.89□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR1AP35321 89 aa4.89□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 PANO1I0J062 215 aa4.88□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 TNP2Q05952 138 aa4.88□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 CSAG1Q6PB30 78 aa4.88□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 Q8NBF4 154 aa4.88□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 FBN3Q75N90 2809 aa4.88□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.87□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 ROMO1P60602 79 aa4.87□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.87□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GW54 56 aa4.86□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.85□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 CDK2AP2O75956 126 aa4.85□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 IGFL1Q6UW32 110 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZR54 194 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 H0Y9P7 68 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.84□□□□□ -1.64
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