RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX46H3BTG2 121 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 GATCO43716 136 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2-30P06310 120 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL7P13232 177 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL15RAQ13261 267 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNPY1Q3B7I2 92 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORMDL2Q53FV1 153 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYDC2Q56P42 97 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GV50 99 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIGD1CA8MV81 97 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf87E5RJ46 101 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCL20P78556 96 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHEBQ15382 184 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01554Q52M75 96 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEND1Q8N111 149 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNRGQ8N5I3 272 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 R4GN34 69 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM223A0PJW6 202 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGIPA6NJ69 53 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 F8W036 122 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFC2O95298 119 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB1D1O95968 90 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPYP01303 97 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 P0C880 135 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 HERV-K104P63124 156 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4orf26Q17RF5 130 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM104BQ5XKR9 115 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIQKQ629K1 86 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORMDL3Q8N138 153 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP1LC3AQ9H492 121 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9JQL5 133 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0YIZ8 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM250H0YL14 139 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EMI3 77 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE6DO43924 150 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A8P05109 93 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERASQ7Z444 233 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEN1Q86WV5 123 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1LQ93083 61 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MANBALQ9NQG1 85 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 hDV103S1A0JD37 113 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A4D1N5 150 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01549A6NIU2 74 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0QZ58 72 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2G10O15496 165 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPC2O95563 127 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 BATFQ16520 125 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 CT83Q5H943 113 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00518Q8N0U6 118 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N8P6 123 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf52Q96A22 123 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRELID3AQ96N28 172 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q9H521 79 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG13Q9P2W3 67 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GVX0 72 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GW15 77 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A5P33763 92 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPC2P61916 151 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFITM2Q01629 132 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE1FQ5T754 118 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf91Q6ZV80 131 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADM2Q7Z4H4 148 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB37Q96AX2 223 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOMM6Q96B49 74 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAT8Q9UHE5 227 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PPM0 123 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BUT2 72 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EN84 100 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFS5O43920 106 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFB1O75438 58 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 HBDP02042 147 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT-ATP8P03928 68 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLC3P0DOY3 106 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf197Q8N268 126 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 OCC1Q8TAD7 63 aa0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.4 ms