RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 PCP2Q8IVA1 136 aa2.16□□□□□ -2.06
LRAT-202ENST00000499392 C14orf144Q96I85 54 aa2.16□□□□□ -2.06
LRAT-202ENST00000499392 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.16□□□□□ -2.06
LRAT-202ENST00000499392 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
LRAT-202ENST00000499392 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
LRAT-202ENST00000499392 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 DPM2O94777 84 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 IGKCP01834 107 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 PFN2P35080 140 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 TMEM223A0PJW6 202 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 TSTD3H0UI37 97 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ERC2-IT1O76042 136 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SPRR1AP35321 89 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 NMUP48645 174 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 CTAG1AP78358 180 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 LINC00483Q53H64 154 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 VAMP8Q9BV40 100 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ERG28Q9UKR5 140 aa2.14□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 COX8AP10176 69 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 G0S2P27469 103 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SEC11AP67812 179 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 MOBPQ13875 183 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.13□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 LINC01549A6NIU2 74 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 NCR3O14931 201 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 LEPROTO15243 131 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 DDTP30046 118 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 Q9BRP9 147 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.12□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 C20orf202A1L168 122 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 J3QQQ9 107 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 DLEU1O43261 78 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SPINK1P00995 79 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 PLNP26678 52 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 PCOTHQ58A44 107 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.11□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 H3BRM9 83 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SMIM13P0DJ93 91 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 COX17Q14061 63 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 C9orf92A6NGG3 77 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ZNF815PA8K554 130 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 FXYD2P54710 66 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 HIGD1BQ9P298 99 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.09□□□□□ -2.07
LRAT-202ENST00000499392 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.08□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SLC25A20O43772 301 aa2.08□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 LINC00158P58513 81 aa2.08□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 NPC2P61916 151 aa2.08□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 Q6ZRX8 168 aa2.08□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 M0R143 59 aa2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 TAX1BP3O14907 124 aa2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 BATFQ16520 125 aa2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 A0A1B0GV90 55 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 K7ERJ3 54 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 TIMM17BO60830 172 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 KRTAP5-8O75690 187 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 IGLV6-57P01721 117 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 HSD52Q0P140 79 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 C5orf47Q569G3 176 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SPANXCQ9NY87 97 aa2.06□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 A0A0G2JQZ4 141 aa2.05□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 SPRR1BP22528 89 aa2.05□□□□□ -2.08
LRAT-202ENST00000499392 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms