RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497811.5

LINC00635-208, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00635, Length 856 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-208ENST00000497811 COX6B1P14854 86 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 CR1P17927 2039 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 CUBNO60494 3623 aa2.11□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 KNL1Q8NG31 2342 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 A0A1B0GU33 70 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 NDUFA3O95167 84 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 MGPP08493 103 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF137PP52743 207 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 CCL18P55774 89 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 WFDC10AQ9H1F0 79 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 ABCA4P78363 2273 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.1□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 ANK2Q01484 3957 aa2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 UQCR11O14957 56 aa2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
LINC00635-208ENST00000497811 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.09□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 RYR3Q15413 4870 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 LCE6AA0A183 80 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 IGIPA6NJ69 53 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 CCL3L1P16619 93 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 GAFA1Q96PS6 74 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.08□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 SONP18583 2426 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 PDE6GP18545 87 aa2.07□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 SPINK7P58062 85 aa2.07□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 SMR3AQ99954 134 aa2.07□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 MED12Q93074 2177 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 NDUFA4O00483 81 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 CTSGP08311 255 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 PDE6HQ13956 83 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 CCL26Q9Y258 94 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 FREM3P0C091 2139 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 HRES1P13985 223 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 PATE1Q8WXA2 126 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 H0YGX0 51 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 HAMPP81172 84 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 TFF3Q07654 80 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 COX17Q14061 63 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DEFB134Q4QY38 66 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 R4GN34 69 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.04□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 IGLV3-1P01715 115 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 IAPPP10997 89 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 COA5Q86WW8 74 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 SPRR4Q96PI1 79 aa2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
LINC00635-208ENST00000497811 DNAJC13O75165 2243 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 FXYD4P59646 89 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 TTTY10Q9BZA0 68 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 VPS13CQ709C8 3753 aa2.02□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 ZANQ9Y493 2812 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 AKAP6Q13023 2319 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 NCR3O14931 201 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 Q6ZTI0 123 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 U3KQA8 63 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 RYR1P21817 5038 aa2.01□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
LINC00635-208ENST00000497811 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms