RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.98□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.98□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 HSPG2P98160 4391 aa6.97□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 MT-ATP8P03928 68 aa6.97□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N377 158 aa6.97□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SLC13A3-211ENST00000495082 CCKP06307 115 aa6.96□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SPRR1BP22528 89 aa6.96□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.96□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SPRR4Q96PI1 79 aa6.96□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.95□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 FAT1Q14517 4588 aa6.95□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM229AH3BQW9 127 aa6.95□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00483Q53H64 154 aa6.94□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.94□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.94□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 DSCR8Q96T75 97 aa6.93□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 PCP4P48539 62 aa6.92□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6ZQT0 140 aa6.92□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 Q5VSD8 79 aa6.92□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM29Q86T20 159 aa6.92□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00846Q9NV44 126 aa6.92□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.91□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 PDE6GP18545 87 aa6.91□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00643Q86TS7 51 aa6.91□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N1X5 172 aa6.9□□□□□ -1.3
SLC13A3-211ENST00000495082 SCGB1A1P11684 91 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.87□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.87□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 F8WEM9 126 aa6.87□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.87□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.87□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6Q795 121 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC13A3-211ENST00000495082 IMUPQ9GZP8 106 aa6.83□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 UBL5Q9BZL1 73 aa6.83□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.82□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 CRYGAP11844 174 aa6.82□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6JHZ5 121 aa6.82□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A087X002 238 aa6.81□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8NBF4 154 aa6.81□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 MOBPQ13875 183 aa6.81□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.81□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.8□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.8□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 IGFL1Q6UW32 110 aa6.8□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.79□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.79□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 HERC2O95714 4834 aa6.79□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6ZVQ6 151 aa6.79□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.78□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.78□□□□□ -1.32
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1W2PNM2 257 aa6.77□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1B0GW54 56 aa6.76□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A0G2JQZ4 141 aa6.75□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.75□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.74□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.73□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.73□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 CXCL6P80162 114 aa6.73□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 CD164Q04900 197 aa6.73□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 NREPQ16612 68 aa6.72□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.71□□□□□ -1.33
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A087WVE0 104 aa6.71□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 MYCBP2O75592 4640 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP10-8P60410 259 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A087WSZ3 146 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 OXTP01178 125 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 SPINK1P00995 79 aa6.66□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.66□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.66□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 BPY2O14599 106 aa6.66□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 Q5XG85 94 aa6.65□□□□□ -1.34
SLC13A3-211ENST00000495082 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.64□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 MT1HL1P0DM35 61 aa6.64□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 TNXBP22105 4242 aa6.63□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 ATOX1O00244 68 aa6.63□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.63□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N9L7 120 aa6.62□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 LIMD2Q9BT23 127 aa6.62□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.62□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV4-1P06312 121 aa6.61□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 DSCR10P59022 87 aa6.6□□□□□ -1.35
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.59□□□□□ -1.35
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