RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CHTF8P0CG12 524 aa8.15□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 B9D2Q9BPU9 175 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 REG3GQ6UW15 175 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PNM2 257 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 C16orf90A8MZG2 172 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 SMIM29Q86T20 159 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.113e-10■□□□□ 9.6
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PRAME-213ENST00000492657 OCR1Q9BZK8 76 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 A0A0G2JQZ4 141 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 TNP2Q05952 138 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 V9GYY9 64 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 C1orf137Q5JT78 98 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRAME-213ENST00000492657 DNHD1Q96M86 4753 aa8.09□□□□□ -1.11
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PRAME-213ENST00000492657 C1orf195Q5TG92 126 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 PSPHP1O15172 72 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 TGP01266 2768 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 PANO1I0J062 215 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 Q8NBF4 154 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 A8MU10 97 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 C14orf177Q52M58 125 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 KMT2AQ03164 3969 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-213ENST00000492657 DNAH2Q9P225 4427 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 NUPR2A6NF83 97 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 K7EQZ3 153 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 SPRR4Q96PI1 79 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GW54 56 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 IGFL1Q6UW32 110 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 DSCR10P59022 87 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 hDV103S1A0JD37 113 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 UBE2AP49459 152 aa7.96□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
PRAME-213ENST00000492657 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 FBN3Q75N90 2809 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WSZ3 146 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WTM6 91 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 A8MUN3 132 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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PRAME-213ENST00000492657 H0Y9J4 135 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-213ENST00000492657 HCG22E2RYF7 251 aa7.9□□□□□ -1.14
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PRAME-213ENST00000492657 SPRR1BP22528 89 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 LCE6AA0A183 80 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 RTL8CO15255 209 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZR54 194 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 LINC00208Q96KT6 92 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-213ENST00000492657 PMAIP1Q13794 54 aa7.84□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 Q1T7F1 81 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 PRR15Q8IV56 129 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 LY6G6CO95867 125 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 MP68P56378 58 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-213ENST00000492657 Q5VV11 94 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 CASC2Q6XLA1 102 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 H3BS24 57 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 PRR15LQ9BU68 103 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 A8MWP4 228 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 H0Y9P7 68 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 NDUFB1O75438 58 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 LINC00483Q53H64 154 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 MOBPQ13875 183 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-213ENST00000492657 ZNF861PO60384 105 aa7.71□□□□□ -1.17
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