RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	CCK	P06307	115 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WTM6	91 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PNN7	141 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		H0Y9J4	135 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZQT0	140 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		Q9BRP9	147 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GW54	56 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6JHZ5	121 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8N377	158 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00846	Q9NV44	126 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	DSCR8	Q96T75	97 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRR1B	P22528	89 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	PANO1	I0J062	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R2N4	97 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	RTL8C	O15255	209 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	BCE1	O60756	84 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2B	P63146	152 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRR4	Q96PI1	79 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6G6C	O95867	125 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL6	P80162	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8NBF4	154 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GV72	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	PRLH	P81277	87 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZSA8	131 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZVQ6	151 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	PKD1	P98161	4303 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PNM2	257 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYGA	P11844	174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf137	Q5JT78	98 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	RYR2	Q92736	4967 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2A	P49459	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247		F8WEM9	126 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF861P	O60384	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	ATOX1	O00244	68 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFL1	Q6UW32	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	LCE6A	A0A183	80 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	NREP	Q16612	68 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV7-43	P04211	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	HAMP	P81172	84 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	TG	P01266	2768 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG4A-208	ENST00000489247	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88

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