RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.44□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.43□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 MT-ATP8P03928 68 aa6.43□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.42□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 FAT1Q14517 4588 aa6.42□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00643Q86TS7 51 aa6.41□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.41□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00846Q9NV44 126 aa6.4□□□□□ -1.38
GTPBP1-211ENST00000487538 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.39□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.39□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 F8WEM9 126 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SPRR1BP22528 89 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP10-1P60331 282 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZSA8 131 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM29Q86T20 159 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.38□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SCGB1A1P11684 91 aa6.37□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf137Q5JT78 98 aa6.37□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6JHZ5 121 aa6.36□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.36□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.36□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 UBL5Q9BZL1 73 aa6.36□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.35□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 CDK2AP2O75956 126 aa6.35□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SCXQ7RTU7 201 aa6.35□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF861PO60384 105 aa6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6Q795 121 aa6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GTPBP1-211ENST00000487538 SPRR4Q96PI1 79 aa6.33□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 IMUPQ9GZP8 106 aa6.33□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GW54 56 aa6.32□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV7-43P04211 117 aa6.32□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8NBF4 154 aa6.32□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.31□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PNM2 257 aa6.31□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZVQ6 151 aa6.31□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 MYCBP2O75592 4640 aa6.3□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00483Q53H64 154 aa6.3□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 IGFL1Q6UW32 110 aa6.3□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 PCP4P48539 62 aa6.29□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 HAMPP81172 84 aa6.29□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 HERC1Q15751 4861 aa6.28□□□□□ -1.4
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYGAP11844 174 aa6.27□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N1X5 172 aa6.27□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL6P80162 114 aa6.26□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 NREPQ16612 68 aa6.26□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0G2JQZ4 141 aa6.25□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.25□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.24□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.23□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.23□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WSZ3 146 aa6.21□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 BPY2O14599 106 aa6.21□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 MOBPQ13875 183 aa6.21□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.21□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WVE0 104 aa6.2□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.2□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.19□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.17□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.17□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 Q5VSD8 79 aa6.17□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 ATOX1O00244 68 aa6.16□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV4-1P06312 121 aa6.15□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.15□□□□□ -1.42
GTPBP1-211ENST00000487538 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N9L7 120 aa6.14□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.14□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 DSCR10P59022 87 aa6.13□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.13□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.13□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.12□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 CD164Q04900 197 aa6.12□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.12□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087X002 238 aa6.11□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 J3KT08 172 aa6.1□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EQZ3 153 aa6.1□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.1□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.1□□□□□ -1.43
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.08□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MWP4 228 aa6.07□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.07□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SERP2Q8N6R1 65 aa6.07□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 Q96NJ1 140 aa6.07□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM229AH3BQW9 127 aa6.06□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 COX7CP15954 63 aa6.06□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC179H3BU77 68 aa6.05□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 UQCRQO14949 82 aa6.05□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR15Q8IV56 129 aa6.05□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.04□□□□□ -1.44
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