RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 EPM2AB3EWF7 344 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 BPY2O14599 106 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZRX8 168 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 C7orf33Q8WU49 177 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 LCE6AA0A183 80 aa6.15□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 H3BS24 57 aa6.15□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV4-1P06312 121 aa6.15□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR1AP35321 89 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SCXQ7RTU7 201 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 KMT2AQ03164 3969 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 F8WEM9 126 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N377 158 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 RYR1P21817 5038 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 HERC2O95714 4834 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH2Q9P225 4427 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 OXTP01178 125 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 C14orf177Q52M58 125 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 Q8NBF4 154 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 PSCAO43653 123 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SNURFQ9Y675 71 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf137Q5JT78 98 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 Q5XG85 94 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 OCR1Q9BZK8 76 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 LY6G6CO95867 125 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR4Q96PI1 79 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.09□□□□□ -1.43
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POLR1A-208ENST00000486964 A0A0U1RQV1 116 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 Q9BRP9 147 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 REG3GQ6UW15 175 aa6.07□□□□□ -1.44
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POLR1A-208ENST00000486964 C16orf90A8MZG2 172 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2BP63146 152 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N9L7 120 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf26Q17RF5 130 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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POLR1A-208ENST00000486964 FAM168BA1KXE4 195 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 RTL8CO15255 209 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM29Q86T20 159 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PNN7 141 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 HCG22E2RYF7 251 aa6□□□□□ -1.45
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POLR1A-208ENST00000486964 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 H0Y9J4 135 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 PANO1I0J062 215 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 DSCR10P59022 87 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.99□□□□□ -1.45
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POLR1A-208ENST00000486964 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.98□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.98□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 K7EQZ3 153 aa5.97□□□□□ -1.45
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POLR1A-208ENST00000486964 LCE1DQ5T752 114 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-208ENST00000486964 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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POLR1A-208ENST00000486964 H3BPC8 53 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR1BP22528 89 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 IGFL1Q6UW32 110 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2AP49459 152 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 MP68P56378 58 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-2P60368 255 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WSZ3 146 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 PKD1P98161 4303 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 hDV103S1A0JD37 113 aa5.91□□□□□ -1.46
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