RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485612.5

SSR4-210, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-210ENST00000485612 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.34□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 LINC00846Q9NV44 126 aa6.34□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.33□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 S100A6P06703 90 aa6.32□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.32□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.31□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 KRTDAPP60985 99 aa6.31□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 PCP2Q8IVA1 136 aa6.31□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 ATOH7Q8N100 152 aa6.31□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 TCL1BO95988 128 aa6.3□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 IFITM1P13164 125 aa6.3□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 NEBP20929 6669 aa6.3□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 S100A2P29034 98 aa6.29□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 A4D1N5 150 aa6.28□□□□□ -1.4
SSR4-210ENST00000485612 F8WEM9 126 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 MT2AP02795 61 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 COPS9Q8WXC6 57 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.26□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.26□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 IGFL1Q6UW32 110 aa6.26□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 Q6ZVH6 145 aa6.26□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 LINC00575Q6W349 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 Q6ZQY7 126 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.24□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 Q75L30 129 aa6.24□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 CLEC2BQ92478 149 aa6.24□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 C20orf202A1L168 122 aa6.23□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 MT1FP04733 61 aa6.23□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 Q6JHZ5 121 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-210ENST00000485612 hADV29S1A0JD25 119 aa6.21□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.21□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP10-10P60014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 VAMP3Q15836 100 aa6.2□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 H3BUT2 72 aa6.19□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 Q96NJ1 140 aa6.19□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.18□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 C12orf57Q99622 126 aa6.17□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 LST1O00453 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
SSR4-210ENST00000485612 A8MUU9 505 aa6.14□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 SCGB1D1O95968 90 aa6.14□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.13□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.13□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.11□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.1□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.1□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 DSCR10P59022 87 aa6.1□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.1□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.09□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.09□□□□□ -1.43
SSR4-210ENST00000485612 A0A087WSZ3 146 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 SMIM6P0DI80 62 aa6.07□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 TEN1Q86WV5 123 aa6.07□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H4GQ99525 98 aa6.07□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 VAMP8Q9BV40 100 aa6.07□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 PYY3Q5JQD4 70 aa6.05□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.05□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 SPATA45Q537H7 98 aa6.04□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 SIGMAR1Q99720 223 aa6.04□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.03□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 FAM236CP0DP71 79 aa6.03□□□□□ -1.44
SSR4-210ENST00000485612 A0A1W2PNM2 257 aa6.02□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 HRES1P13985 223 aa6.02□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 H3BMG7 143 aa6.01□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 COX8AP10176 69 aa6.01□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.01□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.01□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 RAB37Q96AX2 223 aa6□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.99□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 C14orf144Q96I85 54 aa5.99□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 H0YGX0 51 aa5.98□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 IGKV4-1P06312 121 aa5.98□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 FABP2P12104 132 aa5.98□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 LINC00313P59037 77 aa5.98□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 A0A0B4J2C4 111 aa5.97□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 A0A1B0GV72 72 aa5.97□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.97□□□□□ -1.45
SSR4-210ENST00000485612 DLEU1O43261 78 aa5.96□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 SNCGO76070 127 aa5.95□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.95□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.95□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 HIGD1BQ9P298 99 aa5.94□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 A0A1B0GX51 115 aa5.92□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 TRIAP1O43715 76 aa5.92□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.92□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.92□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.91□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
SSR4-210ENST00000485612 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.91□□□□□ -1.46
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