RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZRX8 168 aa10.44□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 Q9BRP9 147 aa10.43□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 CASC10Q5T4H9 136 aa10.43□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 PCOTHQ58A44 107 aa10.42□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 Q5VV11 94 aa10.42□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.42□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 TENM2Q9NT68 2774 aa10.42□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 CD164Q04900 197 aa10.41□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.41□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y9J4 135 aa10.41□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.4□□□□□ -0.74
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.39□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 PRLHP81277 87 aa10.39□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CASC2Q6XLA1 102 aa10.38□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf90A8MZG2 172 aa10.38□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.37□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.36□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.36□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.35□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.35□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 LIMD2Q9BT23 127 aa10.35□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.34□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 H3BNG1 76 aa10.34□□□□□ -0.75
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFS5O43920 106 aa10.33□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 IGFL1Q6UW32 110 aa10.32□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.31□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.3□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 LCE6AA0A183 80 aa10.3□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR4Q96PI1 79 aa10.29□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 COA5Q86WW8 74 aa10.29□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 K7EIL1 84 aa10.28□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 REG3GQ6UW15 175 aa10.28□□□□□ -0.76
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GW54 56 aa10.26□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 LCA10Q71F78 164 aa10.26□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.26□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 TNP2Q05952 138 aa10.26□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.25□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 LYSTQ99698 3801 aa10.23□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 COL7A1Q02388 2944 aa10.23□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.22□□□□□ -0.77
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.21□□□□□ -0.78
CCSAP-204ENST00000483092 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.17□□□□□ -0.78
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.16□□□□□ -0.78
CCSAP-204ENST00000483092 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.15□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.14□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.13□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CHTF8P0CG12 524 aa10.12□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR1AP35321 89 aa10.12□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.11□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 A8MWP4 228 aa10.11□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 Q75L30 129 aa10.11□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK7P58062 85 aa10.11□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.1□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.09□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 PRAC1Q96KF2 57 aa10.09□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.09□□□□□ -0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CDK2AP2O75956 126 aa10.08□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 MOBPQ13875 183 aa10.08□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 H3BPC8 53 aa10.08□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 MDFIQ99750 246 aa10.06□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.05□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 A6NN06 94 aa10.05□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.05□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.01□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.99□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.98□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.97□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.97□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.96□□□□□ -0.81
CCSAP-204ENST00000483092 HRES1P13985 223 aa9.95□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 APLNQ9ULZ1 77 aa9.95□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.95□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.95□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.94□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00313P59037 77 aa9.94□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.94□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 TGP01266 2768 aa9.92□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 PANO1I0J062 215 aa9.9□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.9□□□□□ -0.82
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.9□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf87E5RJ46 101 aa9.89□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.88□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.88□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.87□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.87□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.86□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf177Q52M58 125 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 234.7 ms