RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 MTURNQ8N3F0 131 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 PRYO14603 147 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 NCR3O14931 201 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV6-57P01721 117 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 H3BQ85 93 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR4Q96PI1 79 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 GHRHP01286 108 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 VPS25Q9BRG1 176 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf99Q4VX62 202 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 B5MCH6 92 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 hADV29S1A0JD25 119 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 COX7BP24311 80 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00483Q53H64 154 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00575Q6W349 94 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 MUC2Q02817 5179 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-210ENST00000462125 ERC2-IT1O76042 136 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZRX8 168 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 Q9BRP9 147 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 ACYP1P07311 99 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 TPRXLQ17RH7 258 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 Q8NBF4 154 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 SPINK1P00995 79 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-210ENST00000462125 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 SIGMAR1Q99720 223 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZQY7 126 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 CDIP1Q9H305 208 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 PDE6GP18545 87 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 MOBPQ13875 183 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR1BP22528 89 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 MUC17Q685J3 4493 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB1A1P11684 91 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N377 158 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 CCKP06307 115 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0U1RQV1 116 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 DSCR8Q96T75 97 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00643Q86TS7 51 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 Q6Q795 121 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZQT0 140 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 MT-ATP8P03928 68 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 IMUPQ9GZP8 106 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GW54 56 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 UBL5Q9BZL1 73 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM29Q86T20 159 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GV72 72 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 F8WEM9 126 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 CD164Q04900 197 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 Q6JHZ5 121 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 PCP4P48539 62 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00846Q9NV44 126 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 XP32Q5T750 250 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 LIMD2Q9BT23 127 aa7.31□□□□□ -1.24
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