RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCR10P59022 87 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EQZ3 153 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 PRLHP81277 87 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A096LNI7 61 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 KMT2AQ03164 3969 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-202ENST00000417536 IGFL1Q6UW32 110 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 APLNQ9ULZ1 77 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf90A8MZG2 172 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 PSCAO43653 123 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WSZ3 146 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE6AA0A183 80 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 HCG22E2RYF7 251 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 CHTF8P0CG12 524 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2AP49459 152 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH2Q9P225 4427 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP1-202ENST00000417536 NUPR2A6NF83 97 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP1-202ENST00000417536 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR4Q16378 134 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 PRO0628Q9UI54 55 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 hDV103S1A0JD37 113 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf177Q52M58 125 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR1BP22528 89 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 H0Y9J4 135 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 BRK1Q8WUW1 75 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 MP68P56378 58 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 CASC2Q6XLA1 102 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00208Q96KT6 92 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PANO1I0J062 215 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR15Q8IV56 129 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 LY6G6CO95867 125 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MWP4 228 aa11.46□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFB1O75438 58 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 H0Y9P7 68 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 Q1T7F1 81 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-202ENST00000417536 PSPHP1O15172 72 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BPC8 53 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WTM6 91 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZR54 194 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 Q96NJ1 140 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-202ENST00000417536 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MOBPQ13875 183 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RTL8CO15255 209 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MUN3 132 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00483Q53H64 154 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.21□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.21□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PCOTHQ58A44 107 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFS5O43920 106 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.17□□□□□ -0.62
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