RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 KLKP1Q107X0 134 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRAME-202ENST00000398743 DPH3Q96FX2 82 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-202ENST00000398743 A0A0G2JQZ4 141 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-202ENST00000398743 PANO1I0J062 215 aa8.61□□□□□ -1.03
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PRAME-202ENST00000398743 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.44□□□□□ -1.06
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PRAME-202ENST00000398743 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-202ENST00000398743 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.42□□□□□ -1.06
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PRAME-202ENST00000398743 PRR15Q8IV56 129 aa8.39□□□□□ -1.07
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PRAME-202ENST00000398743 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 TGP01266 2768 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 NDUFB1O75438 58 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 Q96NJ1 140 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 MP68P56378 58 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 IGLV7-43P04211 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP10-2P60368 255 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 hDV103S1A0JD37 113 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 H0Y9P7 68 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 LINC00208Q96KT6 92 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 H3BPC8 53 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRAME-202ENST00000398743 CDK2AP2O75956 126 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GVX0 72 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 PKD1P98161 4303 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZSA8 131 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP10-1P60331 282 aa8.16□□□□□ -1.1
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