RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 HCG22E2RYF7 251 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 A0A087WSZ3 146 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 LCE6AA0A183 80 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PRAME-201ENST00000398741 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-201ENST00000398741 CHTF8P0CG12 524 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-201ENST00000398741 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-201ENST00000398741 COL7A1Q02388 2944 aa8.2□□□□□ -1.1
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PRAME-201ENST00000398741 APLNQ9ULZ1 77 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-201ENST00000398741 FBN3Q75N90 2809 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-201ENST00000398741 LYSTQ99698 3801 aa8.17□□□□□ -1.1
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PRAME-201ENST00000398741 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.17□□□□□ -1.1
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PRAME-201ENST00000398741 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.11□□□□□ -1.11
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PRAME-201ENST00000398741 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-201ENST00000398741 CASC2Q6XLA1 102 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-201ENST00000398741 hDV103S1A0JD37 113 aa8.09□□□□□ -1.12
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PRAME-201ENST00000398741 A8MWP4 228 aa8.08□□□□□ -1.12
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PRAME-201ENST00000398741 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.07□□□□□ -1.12
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PRAME-201ENST00000398741 PRO0628Q9UI54 55 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 PANO1I0J062 215 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 LINC00208Q96KT6 92 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 NUPR2A6NF83 97 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 PRR4Q16378 134 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 H0Y9P7 68 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-201ENST00000398741 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.04□□□□□ -1.12
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PRAME-201ENST00000398741 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.03□□□□□ -1.12
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PRAME-201ENST00000398741 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.02□□□□□ -1.13
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PRAME-201ENST00000398741 H3BPC8 53 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-201ENST00000398741 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.01□□□□□ -1.13
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PRAME-201ENST00000398741 Q1T7F1 81 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-201ENST00000398741 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 A0A087WTM6 91 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 LINC00483Q53H64 154 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 Q96NJ1 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 TENM2Q9NT68 2774 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 RTL8CO15255 209 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 MOBPQ13875 183 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-201ENST00000398741 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.9□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 CDK2AP2O75956 126 aa7.9□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.9□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 PSPHP1O15172 72 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 V9GYY9 64 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 ZNF861PO60384 105 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GVX0 72 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 NDUFS5O43920 106 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-201ENST00000398741 PCOTHQ58A44 107 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZR54 194 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 A8MUN3 132 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 COA5Q86WW8 74 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 LIMD2Q9BT23 127 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 CD164Q04900 197 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-201ENST00000398741 C1orf195Q5TG92 126 aa7.78□□□□□ -1.16
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