RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.47■□□□□ 0.23
GIPC1-201ENST00000345425 H3BQ85 93 aa16.46■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 SPCS1Q9Y6A9 102 aa16.44■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 MYCBP2O75592 4640 aa16.42■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa16.41■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 SMIM29Q86T20 159 aa16.41■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa16.41■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf22Q8N5N4 141 aa16.41■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa16.4■□□□□ 0.22
GIPC1-201ENST00000345425 TYMSOSQ8TAI1 123 aa16.39■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 FAT3Q8TDW7 4589 aa16.38■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 F8WEM9 126 aa16.37■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP10-8P60410 259 aa16.36■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf153Q5TBE3 101 aa16.36■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 H3BMG7 143 aa16.36■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 MOBPQ13875 183 aa16.36■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.34■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 Q8NBF4 154 aa16.34■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 C9JAW5 83 aa16.33■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 K7EP34 96 aa16.33■□□□□ 0.21
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 MT1HL1P0DM35 61 aa16.31■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa16.31■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2V1Q13404 147 aa16.31■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa16.3■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 PCLOQ9Y6V0 5065 aa16.29■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 J3QL48 77 aa16.29■□□□□ 0.2
GIPC1-201ENST00000345425 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa16.24■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD29Q8N6D5 301 aa16.24■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 H3BT86 120 aa16.23■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 Q6JHZ5 121 aa16.21■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 MTURNQ8N3F0 131 aa16.21■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 TNXBP22105 4242 aa16.21■□□□□ 0.19
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00304Q8N9R0 145 aa16.2■□□□□ 0.18
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf48Q5BLP8 95 aa16.17■□□□□ 0.18
GIPC1-201ENST00000345425 SPAG11AQ6PDA7 123 aa16.15■□□□□ 0.18
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GV72 72 aa16.14■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 IGFL1Q6UW32 110 aa16.14■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa16.13■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 RBM3P98179 157 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 PRO0461Q9UI25 63 aa16.11■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JQZ4 141 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 CD164Q04900 197 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 SPINK1P00995 79 aa16.08■□□□□ 0.17
GIPC1-201ENST00000345425 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 F8W1H4 67 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 DSCR8Q96T75 97 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 HRCT1Q6UXD1 115 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa16.03■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa16.03■□□□□ 0.16
GIPC1-201ENST00000345425 RPS29P62273 56 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GIPC1-201ENST00000345425 TEN1Q86WV5 123 aa16■□□□□ 0.15
GIPC1-201ENST00000345425 Q6Q795 121 aa15.99■□□□□ 0.15
GIPC1-201ENST00000345425 PDE6GP18545 87 aa15.97■□□□□ 0.15
GIPC1-201ENST00000345425 C14orf132Q9NPU4 83 aa15.97■□□□□ 0.15
GIPC1-201ENST00000345425 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa15.95■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 CCKP06307 115 aa15.95■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 LIMD2Q9BT23 127 aa15.95■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.95■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PNM2 257 aa15.95■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZQT0 140 aa15.92■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa15.91■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 VPS25Q9BRG1 176 aa15.9■□□□□ 0.14
GIPC1-201ENST00000345425 Q5XG85 94 aa15.88■□□□□ 0.13
GIPC1-201ENST00000345425 ETDBQ3ZM63 59 aa15.87■□□□□ 0.13
GIPC1-201ENST00000345425 A0A087WSZ3 146 aa15.84■□□□□ 0.13
GIPC1-201ENST00000345425 SS18L2Q9UHA2 77 aa15.83■□□□□ 0.12
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GW54 56 aa15.8■□□□□ 0.12
GIPC1-201ENST00000345425 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa15.77■□□□□ 0.11
GIPC1-201ENST00000345425 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.77■□□□□ 0.11
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf195Q5TG92 126 aa15.69■□□□□ 0.1
GIPC1-201ENST00000345425 HERC1Q15751 4861 aa15.69■□□□□ 0.1
GIPC1-201ENST00000345425 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
GIPC1-201ENST00000345425 PRR4Q16378 134 aa15.67■□□□□ 0.1
GIPC1-201ENST00000345425 K7ERU9 68 aa15.64■□□□□ 0.09
GIPC1-201ENST00000345425 Q96NJ1 140 aa15.59■□□□□ 0.09
GIPC1-201ENST00000345425 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa15.58■□□□□ 0.08
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00472Q9H8W2 130 aa15.57■□□□□ 0.08
GIPC1-201ENST00000345425 NREPQ16612 68 aa15.56■□□□□ 0.08
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV4-1P06312 121 aa15.49■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00846Q9NV44 126 aa15.49■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB116Q30KQ4 102 aa15.49■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 SIGMAR1Q99720 223 aa15.48■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 UBL5Q9BZL1 73 aa15.48■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 J3KT08 172 aa15.47■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 ACYP1P07311 99 aa15.47■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa15.46■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 J3QR89 54 aa15.46■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZVQ6 151 aa15.46■□□□□ 0.07
GIPC1-201ENST00000345425 TPRXLQ17RH7 258 aa15.44■□□□□ 0.06
GIPC1-201ENST00000345425 HMCN2Q8NDA2 5059 aa15.39■□□□□ 0.05
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.38■□□□□ 0.05
GIPC1-201ENST00000345425 BPY2O14599 106 aa15.36■□□□□ 0.05
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFB1O75438 58 aa15.33■□□□□ 0.04
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf92A6NGG3 77 aa15.31■□□□□ 0.04
GIPC1-201ENST00000345425 A8MWP4 228 aa15.31■□□□□ 0.04
GIPC1-201ENST00000345425 CDIP1Q9H305 208 aa15.3■□□□□ 0.04
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