RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 H3BQ85 93 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 C10orf25Q5T742 122 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 TENM2Q9NT68 2774 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 LINC00158P58513 81 aa3.97□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 NCR3O14931 201 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 M0R2N4 97 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 COX17Q14061 63 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 TGP01266 2768 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 PSCAO43653 123 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 LY6G6CO95867 125 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.96□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 hDV103S1A0JD37 113 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 LECT2O14960 151 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 LIMD2Q9BT23 127 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 TNP2Q05952 138 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZR54 194 aa3.95□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 H0YGX0 51 aa3.94□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 BCE1O60756 84 aa3.94□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 Q5VV11 94 aa3.94□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.93□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.93□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.93□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 SLPIP03973 132 aa3.93□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.93□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 C14orf177Q52M58 125 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 BPY2O14599 106 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 MOBPQ13875 183 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.92□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.91□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 Q8N814 137 aa3.91□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.9□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2D-28P01615 120 aa3.9□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 Q8NDZ9 215 aa3.9□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.9□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 CDK2AP2O75956 126 aa3.89□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.89□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WTM6 91 aa3.89□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.89□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.89□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.88□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.87□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.87□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 LCE6AA0A183 80 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 RTL8CO15255 209 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 CSAG1Q6PB30 78 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 A0A096LNI7 61 aa3.86□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.85□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.85□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 FAM168BA1KXE4 195 aa3.85□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGLV6-57P01721 117 aa3.85□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 PDE6GP18545 87 aa3.85□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.84□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.84□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.84□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 LUZP6Q538Z0 58 aa3.84□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.84□□□□□ -1.79
CCR6-201ENST00000341935 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.84□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 LINC00208Q96KT6 92 aa3.84□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 CHTF8P0CG12 524 aa3.83□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 K7ERS5 55 aa3.83□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 ERC2-IT1O76042 136 aa3.83□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 C7orf33Q8WU49 177 aa3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 C22orf24Q9Y442 160 aa3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WYN8 130 aa3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PNN7 141 aa3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 RYR2Q92736 4967 aa3.82□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-2P60368 255 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 PANO1I0J062 215 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 LINC00167Q96N53 147 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.81□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 ROMO1P60602 79 aa3.8□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 Q8N9L7 120 aa3.8□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.8□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 FAM229AH3BQW9 127 aa3.8□□□□□ -1.8
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB1O75438 58 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms