RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 COX7BP24311 80 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 MOBPQ13875 183 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 LIMD2Q9BT23 127 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 VPREB1P12018 145 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA3-201ENST00000317201 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 LCE6AA0A183 80 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00208Q96KT6 92 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00313P59037 77 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 Q75L30 129 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 CASC10Q5T4H9 136 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HOXA3-201ENST00000317201 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01554Q52M75 96 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 K7EQZ3 153 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 C14orf177Q52M58 125 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV6-57P01721 117 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SPINK7P58062 85 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 LYSTQ99698 3801 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFB1O75438 58 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXA3-201ENST00000317201 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 H3BQ85 93 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 FBN3Q75N90 2809 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 MP68P56378 58 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 DSCR10P59022 87 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 COA5Q86WW8 74 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 Q6ZR54 194 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PNM2 257 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 Q9BRP9 147 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 TENM2Q9NT68 2774 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 CASC2Q6XLA1 102 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 H0Y9P7 68 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0G2JQZ4 141 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PNN7 141 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 C7orf33Q8WU49 177 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 Q8N377 158 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 A0A087WTM6 91 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 A0A096LNI7 61 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 FAM168BA1KXE4 195 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 LY6G6CO95867 125 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 PCOTHQ58A44 107 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf137Q5JT78 98 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR1AP35321 89 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.15□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.15□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 KMT2AQ03164 3969 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 Q8NBF4 154 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 DNAH2Q9P225 4427 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXA3-201ENST00000317201 CSAG1Q6PB30 78 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 Q6ZRX8 168 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 TGP01266 2768 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 RTL8CO15255 209 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 REG3GQ6UW15 175 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXA3-201ENST00000317201 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms