RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 RTL8CO15255 209 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZRP5 223 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 RETNLBQ9BQ08 111 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 COL7A1Q02388 2944 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 C8orf87E5RJ46 101 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 H0Y9J4 135 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 LIMD2Q9BT23 127 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 KLKP1Q107X0 134 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.96□□□□□ -1.29
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFB1O75438 58 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 C22orf24Q9Y442 160 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 APLNQ9ULZ1 77 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 CHTF8P0CG12 524 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 REG3GQ6UW15 175 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 EPM2AB3EWF7 344 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00167Q96N53 147 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 BCE1O60756 84 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 LYSTQ99698 3801 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 TGP01266 2768 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.9□□□□□ -1.3
PRRX1-201ENST00000239461 TNP2Q05952 138 aa6.9□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.9□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 PRLHP81277 87 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 Q8NDZ9 215 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZRX8 168 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01554Q52M75 96 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 Q8N9L7 120 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 FAM168BA1KXE4 195 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00208Q96KT6 92 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZQT0 140 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.85□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 A0A087WTM6 91 aa6.84□□□□□ -1.31
PRRX1-201ENST00000239461 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.83□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.82□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 LCE6AA0A183 80 aa6.82□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.82□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.81□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 PRAC1Q96KF2 57 aa6.81□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.81□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.8□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GW54 56 aa6.79□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.78□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 Q1T7F1 81 aa6.78□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.78□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 Q9BRP9 147 aa6.78□□□□□ -1.32
PRRX1-201ENST00000239461 hDV103S1A0JD37 113 aa6.77□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0A0MQY5 61 aa6.77□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PNN7 141 aa6.77□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 IGKV4-1P06312 121 aa6.77□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 Q8N377 158 aa6.76□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.76□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 DNAH2Q9P225 4427 aa6.76□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 SMIM29Q86T20 159 aa6.76□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.75□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR1AP35321 89 aa6.74□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.74□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 Q8NBF4 154 aa6.74□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 ERC2-IT1O76042 136 aa6.73□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 MOBPQ13875 183 aa6.73□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-201ENST00000239461 PCOTHQ58A44 107 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00313P59037 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 A0A087WSZ3 146 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 KMT2AQ03164 3969 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 FBN3Q75N90 2809 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms