RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916		H3BMG7	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	LST1	O00453	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	COX6C	P09669	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916		H0YGX0	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	FAT1	Q14517	4588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916		A0A087WYN8	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916		M0QXV9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	SPRR1A	P35321	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916		C9JAW5	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	PRY	O14603	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	TRAC	P01848	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-222	ENST00000613916	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1B0GX51	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		F8W1H4	67 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A20	O43772	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	COX7B	P24311	80 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		B5MCH6	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		Q5VSD8	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZSA8	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		H3BT86	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		Q9BRP9	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZRX8	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	DNAL4	O96015	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	XG	P55808	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	UBE2B	P63146	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-222	ENST00000613916	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZQY7	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916		J3QL48	77 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	PRLH	P81277	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916		H0Y9J4	135 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	BCE1	O60756	84 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	HAMP	P81172	84 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	SNCG	O76070	127 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PVT1-222	ENST00000613916		Q8N377	158 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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