RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 PRR15Q8IV56 129 aa12.5□□□□□ -0.41
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PTPRJ-207ENST00000613246 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.73□□□□□ -0.53
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PTPRJ-207ENST00000613246 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 STAB1Q9NY15 2570 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 C10orf142B7Z368 130 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPEQ02224 2701 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 Q5VV11 94 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP10-3P60369 221 aa11.58□□□□□ -0.56
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