RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597297.1

PDE4C-210, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-210ENST00000597297 Q8N814 137 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00167Q96N53 147 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 PKHD1P08F94 4074 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 A0A096LNI7 61 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 C16orf90A8MZG2 172 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00575Q6W349 94 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 COX7BP24311 80 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4C-210ENST00000597297 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 SNCGO76070 127 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 C22orf24Q9Y442 160 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 A0A087WTM6 91 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.51□□□□□ -1.21
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PDE4C-210ENST00000597297 hADV29S1A0JD25 119 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP10-2P60368 255 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 PRYO14603 147 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 VPS25Q9BRG1 176 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PNN7 141 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 CHTF8P0CG12 524 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4C-210ENST00000597297 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 SPRR1AP35321 89 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZQY7 126 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.44□□□□□ -1.22
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PDE4C-210ENST00000597297 REG3GQ6UW15 175 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZRX8 168 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 PANO1I0J062 215 aa7.41□□□□□ -1.22
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PDE4C-210ENST00000597297 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 CDIP1Q9H305 208 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4C-210ENST00000597297 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP10-1P60331 282 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4C-210ENST00000597297 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.37□□□□□ -1.23
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PDE4C-210ENST00000597297 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.36□□□□□ -1.23
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PDE4C-210ENST00000597297 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.35□□□□□ -1.23
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PDE4C-210ENST00000597297 HSPG2P98160 4391 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4C-210ENST00000597297 HERC2O95714 4834 aa7.34□□□□□ -1.23
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PDE4C-210ENST00000597297 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PDE4C-210ENST00000597297 PRLHP81277 87 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.33□□□□□ -1.24
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PDE4C-210ENST00000597297 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.32□□□□□ -1.24
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PDE4C-210ENST00000597297 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 H0Y9J4 135 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZQT0 140 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 DSCR8Q96T75 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 BCE1O60756 84 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 MT-ATP8P03928 68 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.29□□□□□ -1.24
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