RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CIRBP-232ENST00000591376 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.34□□□□□ -0.75
CIRBP-232ENST00000591376 Q6ZRX8 168 aa10.34□□□□□ -0.75
CIRBP-232ENST00000591376 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.34□□□□□ -0.75
CIRBP-232ENST00000591376 Q9BRP9 147 aa10.34□□□□□ -0.75
CIRBP-232ENST00000591376 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.33□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 NDUFC2O95298 119 aa10.32□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 IGKCP01834 107 aa10.32□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa10.3□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 IGLV6-57P01721 117 aa10.3□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.29□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 NPC2P61916 151 aa10.29□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.29□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 Q8N377 158 aa10.29□□□□□ -0.76
CIRBP-232ENST00000591376 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.27□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 A0A0J9YXY3 114 aa10.26□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A20O43772 301 aa10.26□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.26□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.25□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 C3orf79P0CE67 100 aa10.24□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 LINC01545Q5VT33 79 aa10.24□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 PET117Q6UWS5 81 aa10.24□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 E9PLD3 99 aa10.23□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.22□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.22□□□□□ -0.77
CIRBP-232ENST00000591376 KRTDAPP60985 99 aa10.2□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 C5orf52A6NGY3 159 aa10.19□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.19□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.18□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.18□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 SPANXCQ9NY87 97 aa10.18□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.17□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 XP32Q5T750 250 aa10.16□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 LITAFQ99732 161 aa10.15□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.15□□□□□ -0.78
CIRBP-232ENST00000591376 TIMM17BO60830 172 aa10.14□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.14□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.14□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 S100A6P06703 90 aa10.13□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 SPRR1BP22528 89 aa10.13□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 C20orf202A1L168 122 aa10.12□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.12□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 LIMD2Q9BT23 127 aa10.12□□□□□ -0.79
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CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.11□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF815PA8K554 130 aa10.11□□□□□ -0.79
CIRBP-232ENST00000591376 S100A2P29034 98 aa10.11□□□□□ -0.79
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CIRBP-232ENST00000591376 ATOH7Q8N100 152 aa10.09□□□□□ -0.79
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CIRBP-232ENST00000591376 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.08□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 C6orf99Q4VX62 202 aa10.07□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.07□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 TAL2Q16559 108 aa10.06□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 AKR1D1P51857 326 aa10.05□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.05□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 Q1RN00 199 aa10.04□□□□□ -0.8
CIRBP-232ENST00000591376 C9orf92A6NGG3 77 aa10.03□□□□□ -0.8
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CIRBP-232ENST00000591376 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.01□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 CD164Q04900 197 aa10.01□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 PRO1933Q9H354 126 aa10.01□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 PCOTHQ58A44 107 aa10□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.99□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 PCP2Q8IVA1 136 aa9.99□□□□□ -0.81
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CIRBP-232ENST00000591376 H7C2G1 150 aa9.98□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.97□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1B0GWB2 263 aa9.97□□□□□ -0.81
CIRBP-232ENST00000591376 A6NDN8 102 aa9.96□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 IFITM1P13164 125 aa9.96□□□□□ -0.82
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CIRBP-232ENST00000591376 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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CIRBP-232ENST00000591376 Q5XG85 94 aa9.93□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 Q6ZVH6 145 aa9.93□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.92□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.92□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.92□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 A4D1N5 150 aa9.91□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.91□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 A0A0G2JQZ4 141 aa9.9□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 C1orf195Q5TG92 126 aa9.9□□□□□ -0.82
CIRBP-232ENST00000591376 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CIRBP-232ENST00000591376 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.88□□□□□ -0.83
CIRBP-232ENST00000591376 MT1HP80294 61 aa9.87□□□□□ -0.83
CIRBP-232ENST00000591376 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.86□□□□□ -0.83
CIRBP-232ENST00000591376 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CIRBP-232ENST00000591376 TCL1BO95988 128 aa9.83□□□□□ -0.84
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