RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892		A0A1B0GX51	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	NDUFC2	O95298	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	LINC00158	P58513	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892		A0A0U1RRA0	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	ATP5G1	P05496	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	TNXB	P22105	4242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	DAD1	P61803	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892		H3BNG1	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	LELP1	Q5T871	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-222	ENST00000582892	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	DNAL4	O96015	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	XCL1	P47992	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	REG3A	Q06141	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		H3BQ85	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	PFN2	P35080	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		A0A087WYN8	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		A0A096LPF7	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		F8WDY8	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	LECT2	O14960	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892		Q9HAA7	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NF1-222	ENST00000582892	MUC2	Q02817	5179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892		Q6JHZ5	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892		Q8N814	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	LPA	P08519	4548 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892		A0A087WTM6	91 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	CCK	P06307	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	ESRG	Q1W209	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	PDE6G	P18545	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	OXT	P01178	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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