RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BDP58876 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BCP62807 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 C9orf92A6NGG3 77 aa8.39□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 SERF1AO75920 110 aa8.39□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 IGLV6-57P01721 117 aa8.38□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.37□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.37□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 H0Y8G0 127 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 LEPROTO15243 131 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 LIMD2Q9BT23 127 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 NDUFC2O95298 119 aa8.34□□□□□ -1.07
SPNS2-208ENST00000576635 J3QQQ9 107 aa8.32□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.32□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 C5orf52A6NGY3 159 aa8.31□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 HSBP1O75506 76 aa8.31□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 NPC2P61916 151 aa8.31□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 SPRR1BP22528 89 aa8.3□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 M0R2T5 61 aa8.29□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 NMUP48645 174 aa8.28□□□□□ -1.08
SPNS2-208ENST00000576635 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 PLNP26678 52 aa8.27□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.27□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 HERVK_113P61574 105 aa8.26□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.26□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 LEPROTL1O95214 131 aa8.25□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 FABP4P15090 132 aa8.25□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.25□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.25□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 A0A0J9YXY3 114 aa8.24□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 H7C2G1 150 aa8.24□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 DPM2O94777 84 aa8.24□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.24□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.23□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 CD164Q04900 197 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 Q1RN00 199 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS2-208ENST00000576635 IGKCP01834 107 aa8.21□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.21□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.21□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 C1orf195Q5TG92 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 PRO1933Q9H354 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.2□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.19□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 SPANXCQ9NY87 97 aa8.19□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 Q5XG85 94 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 C3orf79P0CE67 100 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 COX7BP24311 80 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 TAL2Q16559 108 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 LITAFQ99732 161 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 A0A0G2JQZ4 141 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 E9PLD3 99 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 C6orf99Q4VX62 202 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 LINC01545Q5VT33 79 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM29Q86T20 159 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS2-208ENST00000576635 AKR1D1P51857 326 aa8.14□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 S100A6P06703 90 aa8.12□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 KRTDAPP60985 99 aa8.12□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 PET117Q6UWS5 81 aa8.12□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.11□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 TIMM17BO60830 172 aa8.11□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SPNS2-208ENST00000576635 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 S100A2P29034 98 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.06□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF815PA8K554 130 aa8.06□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 ATOH7Q8N100 152 aa8.06□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.06□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 A0A1B0GWB2 263 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 Q6Q795 121 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 TCL1BO95988 128 aa8.04□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.03□□□□□ -1.12
SPNS2-208ENST00000576635 C20orf202A1L168 122 aa8.01□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 A6NDN8 102 aa7.99□□□□□ -1.13
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