RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568053.5

NPIPB13-206, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family, member B13, human

TSL 4

Gene NPIPB13, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB13-206	ENST00000568053	LINC00614	P0C842	121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	COX17	Q14061	63 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053		H0Y8G0	127 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	MOBP	Q13875	183 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053		Q75L30	129 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BK	O60814	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HSBP1	O75506	76 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SERF1A	O75920	110 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SPRR1A	P35321	89 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	NPC2	P61916	151 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	S100A6	P06703	90 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053		Q8N377	158 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053		Q9BRP9	147 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	FABP4	P15090	132 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	DDT	P30046	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	LEPROTL1	O95214	131 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SPINK1	P00995	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	S100A2	P29034	98 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HERV-K104	P63124	156 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	CTAG1A	P78358	180 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	C5orf52	A6NGY3	159 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	LEPROT	O15243	131 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053		Q6ZRX8	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NPIPB13-206	ENST00000568053	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053		J3QQQ9	107 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	S100A12	P80511	92 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	SLC25A20	O43772	301 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	KRTDAP	P60985	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053		A0A0J9YXY3	114 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053		H7C2G1	150 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	DPM2	O94777	84 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	IGKC	P01834	107 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	PCOTH	Q58A44	107 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3	□□□□□ -1.93
NPIPB13-206	ENST00000568053	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3	□□□□□ -1.93

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