RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MRAP	Q8TCY5	172 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf33	Q8WU49	177 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		12	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RMI2	Q96E14	147 aa		12	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MAST4	O15021	2626 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PRY	O14603	147 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf197	Q8N268	126 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRX8	168 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N377	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GW54	56 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NREP	Q16612	68 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR1A	P35321	89 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RRN3-205	ENST00000563559	KLKP1	Q107X0	134 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM168B	A1KXE4	195 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559		Q9BRP9	147 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	BPY2	O14599	106 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559		H7BZZ5	65 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV4-1	P06312	121 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM236C	P0DP71	79 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TNP2	Q05952	138 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFC1	O43677	76 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf137	Q5JT78	98 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ERC2-IT1	O76042	136 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559		K7EIL1	84 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2B	P63146	152 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N9L7	120 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559		Q8NBF4	154 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PNM2	257 aa		11.77	□□□□□ -0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SNURF	Q9Y675	71 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR4	Q96PI1	79 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OXT	P01178	125 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559		F8WEM9	126 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OCR1	Q9BZK8	76 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PSCA	O43653	123 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LNI7	61 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf177	Q52M58	125 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM29	Q86T20	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQV1	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PNN7	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DSCR10	P59022	87 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf47	Q569G3	176 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PRLH	P81277	87 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559		Q5XG85	94 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	IGFL1	Q6UW32	110 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y9J4	135 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	LCE6A	A0A183	80 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559		K7EQZ3	153 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		11.53	□□□□□ -0.56

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