RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	VPREB1	P12018	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LST1	O00453	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		Q5VSD8	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		A0A087WTM6	91 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		B5MCH6	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		M0R378	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		Q8N814	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		A0A096LNI7	61 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		F8W1H4	67 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		H0YGX0	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	FAT1	Q14517	4588 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		A0A087WYN8	130 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		C9JAW5	83 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395		M0QXV9	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	TRAC	P01848	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPM1-231	ENST00000561395	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1B0GX51	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SLC25A20	O43772	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395		H3BT86	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	XG	P55808	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PNN7	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	PRY	O14603	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	DNAL4	O96015	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	COX7B	P24311	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	PANO1	I0J062	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SPRR1A	P35321	89 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	SNCG	O76070	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395		K7ERU9	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZRX8	168 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	UBE2B	P63146	152 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZQY7	126 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395		H3BQ85	93 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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