RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WYN8 130 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRR-209ENST00000549308 MTURNQ8N3F0 131 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-209ENST00000549308 C9JAW5 83 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-209ENST00000549308 TRACP01848 142 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-209ENST00000549308 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-209ENST00000549308 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRR-209ENST00000549308 H3BT86 120 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRR-209ENST00000549308 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRR-209ENST00000549308 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRR-209ENST00000549308 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZSA8 131 aa7.52□□□□□ -1.2
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PTPRR-209ENST00000549308 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRR-209ENST00000549308 SCXQ7RTU7 201 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-209ENST00000549308 PRLHP81277 87 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-209ENST00000549308 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZQY7 126 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRR-209ENST00000549308 UBE2AP49459 152 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-209ENST00000549308 HAMPP81172 84 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-209ENST00000549308 Q9BRP9 147 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRR-209ENST00000549308 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-209ENST00000549308 K7ERU9 68 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRR-209ENST00000549308 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-209ENST00000549308 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-209ENST00000549308 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRR-209ENST00000549308 SPRR4Q96PI1 79 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRR-209ENST00000549308 F8WEM9 126 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRR-209ENST00000549308 SPRR1BP22528 89 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRR-209ENST00000549308 DSCR8Q96T75 97 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM29Q86T20 159 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRR-209ENST00000549308 PKHD1P08F94 4074 aa7.29□□□□□ -1.24
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