RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 C15orf56Q8N910 161 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 F8WEM9 126 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 BPY2O14599 106 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR1AP35321 89 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 KLKP1Q107X0 134 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZRX8 168 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 NF1P21359 2839 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP10-11P60412 298 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZRP5 223 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 H0Y9J4 135 aa3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 DPH3Q96FX2 82 aa3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A087WVE0 104 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8NDZ9 215 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C7orf33Q8WU49 177 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR4Q96PI1 79 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 JMJD1CQ15652 2540 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 NOTCH2Q04721 2471 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C16orf90A8MZG2 172 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 NDUFB1O75438 58 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C5orf47Q569G3 176 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C1orf137Q5JT78 98 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 REG3GQ6UW15 175 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C20orf197Q8N268 126 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8N377 158 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 MTORP42345 2549 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 ACANP16112 2415 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 ITPR2Q14571 2701 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 VPS13CQ709C8 3753 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 H3BPC8 53 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 PSCAO43653 123 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM236CP0DP71 79 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8NBF4 154 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TENM4Q6N022 2769 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2BP63146 152 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 H7BZZ5 65 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR1BP22528 89 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 RETNQ9HD89 108 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NUPR2A6NF83 97 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 EPM2AB3EWF7 344 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 IGKV4-1P06312 121 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 B9D2Q9BPU9 175 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 MP68P56378 58 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 Q9BRP9 147 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 OCR1Q9BZK8 76 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFHX3Q15911 3703 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 LCE6AA0A183 80 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A1W2PNM2 257 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 K7EIL1 84 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A0U1RQV1 116 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 hDV103S1A0JD37 113 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 HCG22E2RYF7 251 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 M0R2N4 97 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2AP49459 152 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 APLNQ9ULZ1 77 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 V9GYY9 64 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 C3orf84H3BNL1 204 aa3.17□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms